Backup y restore de todas las bases de datos en mysql

Para hacer el backup, el dump de todas las bases de datos:

mysqldump -h server -u root -p --all-databases > all_dbs.sql

Para hacer el restore del dump de todas las bases de datos:

mysql -u root -p < all_dbs.sql

Fuente: http://stackoverflow.com/questions/4749448/mysql-dump-all-databases-and-create-or-recreate-them-on-import